根据主要病因的解剖部位不同，闭经可分为子宫性、卵巢胜、垂体性及下丘脑性4类。
1、子宫性闭经及病因：所谓子宫性闭经，是指由于子宫疾病致子宫内膜缺如而引起的闭经。由于子宫内膜缺如，故黄体酮及人工周期试验均阴性。造成子宫性闭经的原因有：
（1）先天性无子宫或发育不良。子宫形如结节，阴道缺如，可致原发性闭经。此类患者体型及发育正常，但常伴有骨骼发育不良、脊柱弯曲及肾脏畸形。卵巢功能正常，有排卵，基础体温双向，促性腺激素正常。
（2）后天性子宫内膜损伤。由于严重产后感染、严重的结核性子宫内膜炎或放射治疗，可引起闭经；人工流产时刮宫过度，使宫腔内形成瘢痕或粘连也会引起闭经。
（3）子宫内膜反应不良。因哺乳时间过长或长期服用避孕药，使性激素长期缺乏，引起子宫内膜过度萎缩，可致闭经。
2、卵巢性闭经及病因：卵巢性闭经，是由于卵巢的原因，引起内源性雌激素缺乏，而发生的闭经。人工周期试验阳性，促性腺激素水平增高。引起卵巢性闭经的主要病因有：
（1）先天性无卵巢或发育不良（较少见）。
（2）卵巢破坏。如：手术、放疗、炎症或肿瘤破坏卵巢引起的闭经。
（3）卵巢肿瘤。有些可产生雄激素的肿瘤，通过抑制卵巢功能致闭经；产生雌激素的卵巢肿瘤通过抑制排卵而致闭经。
（4）卵巢功能早衰。40岁以前闭经绝经者，为卵巢功能早衰。可出现不同程度的更年期症状。
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3、脑垂体性闭经及病因：见于脑垂体损坏；脑垂体肿瘤，原发性脑垂体性促腺功能低下而引起的闭经。常见原因有：
（1）垂体损伤。由于头颅损伤或颅内手术、放射、炎症等原因使垂体损伤引起垂体功能减退，卵巢功能低落，导致闭经。
（2）垂体肿瘤。是器质性病变中引起闭经的最常见原因，有的可出现溢乳。
（3）“空”蝶鞍综合征。此征属先天疾患，引起闭经，但不会发展到垂体衰竭。
4、下丘脑性闭经及原因：丘脑下部性闭经常见于下列因素：
（1）精神神经因素。突然或长期的精神压力，如精神紧张、恐惧、忧虑及环境改变、寒冷刺激等都可引起神经内分泌障碍而导致的闭经。
（2）消耗性疾病及营养不良症。如严重肺结核、贫血及青年妇女的神经性厌食等。
（3）药物抑制综合症。如少数服用长效或短效避孕药的妇女停药后可发生闭经。利血平、氯丙嗪、眠尔通等，也可引起闭经。