治疗女性性交疼痛应该先弄清原因，根据不同病情和原因进行治疗。
由精神心理因素引起的性交疼痛，应加强性知识的学习，使女性知道阴道上有许多皱褶，阴道有较大的伸展性，可以容纳任何大小的阴茎，甚至在生孩子时可以通过胎儿，所以不必为男子阴茎的大小而担忧。使男性知道，女性在性交前需要由男性的亲吻、爱抚等准备活动来激发女性的性冲动，才能使阴道变得润滑，使阴茎易于插入。在性活动中男方切忌强行、粗暴地插入阴茎；最好由女方将阴茎纳入阴道。性活动是双方的协调活动，与双方的情绪和情感有密切关系，如果女方情绪不佳，不想参加性活动，或夫妻感情不和时，最好避免性活动。器质性病变引起的性交疼痛，应治疗原发病，原发病治愈后，性交疼痛自然可以痊愈。如子宫内膜异位症、子宫肌瘤、胯肮炎、尖锐湿疣，这些疾病不治愈，由其产生的性交疼痛很难治愈。萎缩性阴道炎，抗菌素及性激素合用，常能收到较好效果。如由于粗暴性交引起的性器官损伤，不仅要治疗损伤，还要改变性交的粗暴动作。阴道润滑性不够的，一方面延长事前的准备期，另一方面可以用些润滑剂。有些深部性交捕，改变性交体位，如侧位、后位、女上位等，避免阴茎插入阴道过深，或女方控制阴茎插入阴道的深度，常可以避免性交疼痛的发生。